По общему правилу истечение действия срока договора не влияет на освобождение об ответственности по такому договору, в том числе в части уплаты неустойки, как указывал в п. 68 Постановления от 24.03.2016 N 7 Пленум Верховного Суда РФ. Однако в соответствии с абзацем 1 п. 3 ст. 425 ГК РФ стороны вправе предусмотреть в соглашении исключение из данного правила.
Так, например, согласно материалам дела N А40-125640/2020, Истец обратился в Арбитражный суд Московского округа с кассационной жалобой.

Как было установлено судами двух инстанций в ходе рассмотрения дела по существу,
16 января 2019 г. стороны заключили соглашение, в рамках которого истец (поставщик) осуществил в адрес ответчика (заказчика) поставку по универсальному передаточному документу (счет-фактура и товарная накладная), подписанному обеими сторонами без замечаний и претензий по качеству и количеству, товар на общую сумму 5 250 000 рублей.
В нарушение условий контракта оплата товара ответчиком была произведена с нарушением срока.

В связи с просрочкой оплаты поставленного товара истцом на основании п. 7.8. Договора была начислена неустойка за период с за период с 13 февраля 2019 года по 28 февраля 2019 года в размере 21 700 рублей, а также проценты за пользование чужими денежными средствами за период с 01 марта 2019 года по 05 августа 2019 года в размере 174 041 рублей 10 копеек.

В ходе рассмотрения кассационной жалобы суд указал, что выводы судов о том, что прекращение действия договора освобождает ответчика от санкций за просрочку оплаты (имевшей место после истечения срока действия договора) является ошибочными (Постановление Президиума ВАС РФ от 12.11.2013 N 8171/13 по делу N А41-19033/2012, Определение Верховного Суда РФ от 20.02.2019 N 302-ЭС19-109 по делу N А19-15840/2015, Определение Судебной коллегии по экономическим спорам Верховного Суда Российской Федерации от 21.01.2020 по делу N 305-ЭС19-16367, А41-76713/2018 и др.).

Если же при расторжении договора основное обязательство не прекращено, то по смыслу приведенного разъяснения неустойка за его неисполнение (ненадлежащее исполнение) продолжает начисляться.

В настоящем деле обязательство оплатить поставленный товар в момент расторжения соглашения прекращено не было.

Судами не установлено, что истечение срока действия договора (исходя из буквального толкования) влечет прекращение обязательств по оплате товара, поставленного и принятого ответчиком и, как следствие, невозможность начисления неустойки за просрочку оплаты товара.
Иными словами, для того, чтобы неустойка не подлежала начислению после истечения срока действия договора, стороны могут указать в договоре следующее условие:
Неустойка за просрочку исполнения обязательства по Договору подлежит начислению до истечения срока действия Договора. С истечением срока поставки начисление неустойки прекращается

Исходя из всего вышеуказанного, когда в соглашении специально не закреплено, что прекращение действия договора влечет прекращение обязательств, в том числе по уплате неустойки, то это не означает, что стороны могут не исполнять свои обязательства за пределами срока действия договора.